Recursos

1. Portals de dades

Accedeix als nostres portals de dades on podràs trobar totes les dades produïdes en el marc de la Iniciativa Catalana pel a l’Earth Biogenome Project. Aquests portals proporcionen un accés fàcil a les dades per a una anàlisi i exploració més aprofundides

2. Directrius d’enviament de dades

Si heu rebut finançament d’un projecte de la Iniciativa Catalana per a l’Earth BioGenome Project (CBP), o bé esteu seqüenciant un genoma amb recursos propis però voleu que quedi sota el paraigües de la CBP, haureu de penjar les dades de les vostres espècies al Portal (mostra local), crear un biosample a l’ENA i dipositar el testimoni en una institució pública. A continuació trobareu una explicació bàsica sobre cadascun d’aquests processos i uns documents que us podeu descarregar amb tota la informació necessària per completar aquests passos, amb explicacions detallades, indicacions i tutorials. Per qualsevol dubte ens podeu contactar a catbiogenoma@correu.iec.cat.

 

Informació rellevant:

 PERMISOS DE CAPTURA I RECOL·LECCIÓ

Tots els projectes subvencionats per la CBP han de comptar amb permisos oficials de recol·lecció per a les mostres que es volen seqüenciar. Per a més informació d’on aconseguir permisos de recol·lecció de mostres al territori de parla catalana podeu consultar el document adjuntat a continuació:

*Aquestes guies encara estan en desenvolupament

– PUJAR LES DADES DELS ORGANISMES AL PORTAL

Els organismes s’hauran d’incorporar al portal (https://dades.biogenoma.cat) tant bon punt s’hagi recol·lectat l’individu i en un període màxim de tres mesos des de l’inici del projecte. Es recomana  proveir un testimoni electrònic (fotografies) de l’individu de referència que es penjaran conjuntament amb les dades locals de la mostra. Per a més informació sobre com pujar les dades de l’espècie i el testimoni electrònic al portal consulteu la Guia per a la incorporació de dades al portal.

– DIPÒSIT DELS TESTIMONIS A REPOSITORIS PÚBLICS

Tots els genomes de referència hauran de comptar amb un testimoni físic que s’haurà de dipositar a un repositori d’accés públic. Des de la CBP proposem tres institucions col·laboradores que poden actuar de repositoris d’animals (Museu de Ciències Naturals de Barcelona; MCNB), de plantes vasculars (Herbari de l’Institut Botànic de Barcelona; Herbari BC) i de plantes no vasculars, algues i fongs (Centre de Documentació de Biodiversitat Vegetal de la Universitat de Barcelona; Herbari BCN). 

Per a més informació:

3. Repositori principal de GitHub

Visita el nostre repositori principal a GitHub on podràs accedir a codi, scripts i altres recursos relacionats amb els nostres projectes. Col·labora amb nosaltres i contribueix al desenvolupament d’eines i programari de codi obert